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Construcción de la población inicial

Internamente, el programa construye una tabla identificando a cada individuo (no se trata de una simulación global. Si al población incluye a 1000 individuos, a cada uno de ellos está asociada una variable con su sexo y genotipo).
Al llenar la tabla existe una primera elección al azar. Si al inicio del se eligen frecuencias de 50% 50% para dos alelos de un gen, en la primera generación, la frecuencia observada muy probablemente estará diferente de 50%. En realidad, es una probabilidad de 0,5 para cada alela que fue elegida. El sorteo bien puede favorecer un u otro alelo.
Cuanto más numerosa es la población, cuanto más próximas las frecuencias serán de la probabilidad. La discrepancia será especialmente más importante para las pequeñas poblaciones.
Todo pasa como si, empezando con una población muy amplia, se elegía una muestra tomada al azar.Esta discrepancia simula precisamente el efecto fundador.